- Sekretariat Jenderal 15 formasi
- Direktorat Jenderal Perhubungan Darat 3 formasi
- Direktorat Jenderal Perhubungan Laut 723 formasi
- Direktorat Jenderal Perhubungan Udara 56 formasi
- Direktorat Jenderal Perkeretaapian 4 formasi
- Badan Pengelola Transportasi Jabodetabek 2 formasi